Profils génétiques des parasites Schistosoma haematobium des zones chaudes de transmission au Mali

Parasites & Vecteurs volume 16, Numéro d'article : 263 (2023) Citer cet article

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Bien que la schistosomiase soit un problème de santé publique au Mali, le profil génétique du parasite est mal connu. Le but de cette étude était d'analyser le profil génétique des schistosomes du groupe Schistosoma haematobium chez les enfants d'âge scolaire dans différents sites du Mali.

Des échantillons d'urine ont été collectés du 7 au 21 novembre 2021 et soumis à une méthode de filtration pour détecter la présence d'œufs de S. haematobium. L'étude s'est déroulée dans deux villages d'endémie bilharziose (Fangouné Bamanan et Diakalèl), qualifiés de hotspots selon la définition de l'Organisation Mondiale de la Santé (OMS). Le génotypage moléculaire sur Cox1 et ITS2/18S a été utilisé pour l'attribution taxonomique des œufs.

Au total, 970 miracidia ont été collectés individuellement auprès de 63 enfants d'âge scolaire et stockés sur des cartes Whatman FTA pour analyse moléculaire. Après génotypage, 42,0 % (353/840) et 58,0 % (487/840) des miracidies ont révélé des profils de Schistosoma bovis et de S. haematobium Cox1, respectivement ; 95,7 (885/925) et 4,3 % (40/925) ont révélé S. haematobium et S. haematobium/S. profils curassoni pour les gènes ITS/18S, respectivement. Il existait une différence significative dans la répartition des profils Cox1 et ITS2/18S selon les villages (P < 0,0001). Au total, 45,6% (360/789) étaient des hybrides, dont 72,0% (322/447) originaires de Diakalèl. Trois profils d'hybrides (Sb/Sc_ShxSc avec 2,3 % ; Sb/Sc_ShxSh avec 40,5 % ; Sh_ShxSc avec 2,8 %) et un profil pur (Sh_ShxSh avec 54,4 %) ont été identifiés.

Nos résultats montrent, pour la première fois à notre connaissance, une forte prévalence de schistosomes hybrides au Mali. D'autres études sont nécessaires sur la génétique des populations de schistosomes à l'interface humaine et animale pour évaluer le flux génétique du parasite et ses conséquences sur l'épidémiologie de la maladie ainsi que sur la transmission à l'homme.

La schistosomiase est une maladie parasitaire d’importance médicale et vétérinaire qui touche principalement les zones tropicales et subtropicales. Selon l'OMS [37], la schistosomiase touche près de 240 millions de personnes dans le monde, dont 85 % vivent en Afrique, et > 700 millions de personnes vivent dans des zones d'endémie. Au Mali, les prévalences nationales d'infection estimées en 2004-2006 étaient respectivement de 38,3 % et 6,7 % pour Schistosoma haematobium (Sh) et S. mansoni (Sm) [10]. Alors que la prévalence élevée de Sh est répandue dans toutes les régions du Mali, les infections à Sm sont principalement limitées à de petits clusters au centre du pays (districts de Macina et Niono dans la zone d'irrigation de l'Office du Niger) et à Baguineda, à 30 km de Bamako [8, 10 , 33]. Outre les hôtes vertébrés humains, certaines espèces de Schistosoma peuvent également affecter le bétail. Au total, on estime qu’environ 165 millions d’animaux parasités dans le monde souffrent d’entérite hémorragique, d’anémie et de cachexie, et en meurent le plus souvent [12]. En Afrique, trois espèces de Schistosoma sont impliquées dans l'infestation du bétail : S. bovis (Sb), S. mattheei (Sma) et S. curassoni (Sc) [23]. (Sb) est le schistosome animal le plus étudié. Sb a été signalé pour la première fois au Mali en 1988 dans le delta central du Niger, où la prévalence chez les animaux atteint 80 % [31]. Deux ans plus tard, des prévalences de 62,5 % et 85,1 % pour Sb et Sc ont été rapportées dans les abattoirs des villes de Bamako et Mopti [26]. Au-delà de ces cas rapportés au Mali, le Sb est présent dans la zone méditerranéenne et dans toute l'Afrique subsaharienne, notamment en Afrique de l'Ouest où il a été signalé dans presque tous les pays (Burkina Faso, Gambie, Ghana, Guinée, Bissau-Guinée, Mauritanie, Niger). , Nigeria, Sénégal, Mali, Côte d'Ivoire et Togo) [17, 21].

L'hybridation est un phénomène biologique qui correspond à la rencontre et au croisement entre deux entités génétiques distinctes préalablement définies comme espèces différentes [15, 20]. L'hybridation peut représenter une réelle préoccupation en termes de transmission parasitaire, d'épidémiologie et de morbidité. L'hybridation chez les parasites peut compliquer la prévention, le contrôle efficace et le traitement de la maladie [3] car les formes hybrides présentent parfois une virulence et/ou une résistance aux traitements plus élevée que leurs espèces progénitrices [16, 30]. L'étude de l'hybridation a suscité un regain d'intérêt depuis l'utilisation généralisée d'outils moléculaires pour l'identification des parasites. Il est intéressant de noter que des œufs de forme typique (Sb) ont été trouvés dans les selles humaines [25], mais à ce jour, aucun outil moléculaire n'est disponible pour déterminer le statut hybride de ces œufs. Aujourd’hui, des hybridations naturelles entre schistosomes ont déjà été identifiées, notamment entre différentes espèces de schistosomes infectant les animaux comme les croisements SbxSc au Sénégal et au Mali [26, 34], entre espèces de schistosomes infectant les humains et les animaux comme les croisements ShxSb dans plusieurs pays d’Afrique de l’Ouest [ 2, 14, 22, 27, 34] et entre les croisements de schistosomes ShxSm infectant l'homme au Sénégal et en Côte d'Ivoire [13, 19].